A la hora de trasladar a una colonia del tubo de ensayo al hormiguero, es necesario poner el tubo en la caja de forrajeo o se puede conectar el tubo con el interior del hormiguero directamente?

Las dos maneras son validas!

Hay dos formas de hacer la mudanza:
1. A su ritmo, cuando ellas quieran, dejando el tubo dentro del forrajeo o conectado da igual, tiene el mismo efecto.
2. A lo brutote, volcando el contenido del tubo dentro del forrajeo. Yo no te recomiendo esta practica pues las estresas mucho más y puede que queden huevos en el algodón que tu no ves. Existe un video de Formica donde te muestra como sacar los huevos y larvas con un pincel.

Tu has escogido el punto 1, que me parece correcto, si te cabe el tubo dentro del forrajeo te evitas la conexión y tener el tubo colgando. Piensa que en este metodo pueden tardar semanas en hacer la mudanza así que ten paciencia. Espera a que no tengan agua en el tubo, tubo descubierto-hormiguero a oscuras, etc....
Saludos