Como podria taponar el hormiguero de las Pheidole sin que sean algodon ni un trozo de media,ya que lo hacen trizas todo y esta el hormiguero lleno de cachos pequeños de media,y ya tengo probado con algun tubo con silicona dentro pero no se como esta construida la conexion del hormiguero que acaban saliendo

Si el problema es de una conexión te aconsejo selles con silicona caliente. Las hormigas de tamaño pequeño son muy escurridizas.

Aunque lo suyo es que por más foto de por dónde se te escapan, tipo de hormiguero etc... Para poder aconsejarte mejor

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Pero si uso silicona caliente no me quedara inservible ya esa conexión?

Deberías indicar que hormiguero tienes, o poner una foto.
Un buen tapón de algodón debería aguantar. Otra cosa son las juntas, como las de los hormigueros de anthouse, que igual te compensa fijar un tubo de goma con pegamento caliente y luego meter el algodón. Pero sin ver el hormiguero es difícil aconsejar.

La usas para algo?
Yo la sellaría de forma semipemanente, plástico + cola caliente, se suele poder despegar si lo necesitas más adelante, si no te fías haz una prueba con una gota.
Ese hormiguero aún tiene mucho espacio antes de necesitar ampliar.

Ya lo he sellado metiéndole silicona en caliente por toda la conexión y por todo alrededor para asegurarme bien,aún así no se dónde lei que las pheidole pueden roer materiales en apariencia resistentes